2011年以来，受全球经济下行影响，国际棉花市场价格大幅下降。至2014年，国家连续三年实行临时收储政策，导致国内外棉花市场价差拉大，国外棉花大量涌入，国内库存高企，财政负担沉重。过往常用的临时收储、最低保护价、定额补贴等传统支持政策，已经不能适应国际市场新变化，亟需创新价格形成机制，摸索出一条符合中国国情的新路，应对国际市场形势复杂严峻的挑战，确保棉花产业安全。
在此背景下，国家充分考虑新疆特殊区情和经济社会发展现实需要，于2014年在我区探索启动棉花目标价格改革试点工作。2014-2018年，自治区认真贯彻落实国家部署要求，较好地完成了改革任务：
一、摸底数，夯实改革基础。组织自治区、地(州、市)、县(市)、乡、村五级开展核查，摸清棉花种植面积基数。同时，建成棉花目标价格改革信息平台，实现棉花全产业链信息电子档案管理和全程监控，确保补贴资金安全、及时、准确兑付。
二、建机制，保障政策运行。根据国家要求，我们自主设计棉花目标价格改革政策及相关配套措施，按照“不适则改”的原则，完善政策设计，调整补贴形式，优化实施环节，建立协商机制，强化制度监管，实现新旧制度无缝衔接，保障改革平稳运行。
三、抓重点，转变改革方向。紧紧抓住改革核心问题，将政府补贴由“暗补”变为“明补”，创新补贴方式，实现由“60%面积+40%交售量”到“10%南疆四地州面积+90%全区交售量”的转变，引导棉花种植向高产高质高效方向发展。
四、探新路，提升自主水平。为探索新型补贴方式，积极与国际市场接轨，择机开展了棉花目标价格改革补贴与质量挂钩试点和棉花“价格保险+期货”试点，提高棉花质量意识，提升市场自主运行水平，激发棉花产业两端深度融合。
五、强监管，规范市场秩序。建立在库公检、专业监管仓储等制度，开展棉花加工企业公示、诚信经营评价，彻查严惩“转圈棉”、虚开发票等套取补贴违法行为，强化事中事后监管，打造良好市场环境。
五年改革探索，成效超出预期，基本实现了国家既定目标——以需求为导向的市场定价机制基本建立，国内外棉花市场价差明显减小、价格同步波动，关税保护功能逐步恢复，市场主体的竞争意识、风险意识、质量意识明显增强，棉农基本利益得到有效保障，种植业结构渐趋优化，棉花产业和纺织服装产业发展质量不断提升。
